故事的舞台为死后的世界，在这里的少年少女们，要向命运发起挑战。因为某个原因被送来死后世界学校的少年“音无”，在那里遇到了自称“百合”的少女，她为了反抗制造出如此不合理世界的神，而组成了“死后世界战线（SSS）”，她则是领导人。每天都在与敌人战斗。而站在SSS敌方的，则是神的使者，名为“天使”的娇小少女。
对于没有生前的记忆，而面对死后世界的情况也一头雾水的音无，他会选择与百合一起，向命运抗争吗？动画与游戏的不同之处本作是总共六部游戏中的第一部。与动画版一话一话地进行不同，游戏版是按照一天一天的进度来进行游戏的。
日常生活分为上午和下午，上下午分别可以选择不同的角色来进行接触，所以大家可以与自己中意的角色自由发展，从而加深羁绊。在动画中并未阐明的事情，在游戏中可是会一一揭晓的哦。
天使的心跳中文版主角介绍
立华奏
死后世界学校学生会长，主要责任是维护学校学生的秩序。虽然身材娇小但通过程序编辑使自己拥有超人般的体质和攻击防御都非常强力的武器，
还能够使自己拥有了一双翅膀（音无的推荐），完全展开就像天使一般，尽管本人并不认同这个称号
技能
在使用Hand sonic和Distortion之前都先说了Guard s
技能
kill，证明其使用能力要先选择所需技能大类，然后再选择其下的分支技能。Hand sonic和Distortion在面对物理攻击时都会出现飞散的“0”和“1”（“0”和“1”是电脑的二进制语言）。
Hand sonic（音速手刃）
根据需要单体二体均可，可以进行版本切换转换不同形态。Hand Sonic 在使用Version切换时，需要按照Version次序（版本号）切换。但在使用Handsonic Version5时无需按次序，直接即可召唤。
Hand sonic（音速手刃）：首次出现于第一话，在手背处形成短剑可用于攻击与格挡。
Hand sonic version2（音速手刃2代）：出现于第六话，Hand sonic的加强版，据说V2是强化了高速性能的超薄型态
Hand sonic version3（音速手刃3代）：出现于第六话，形似三叉戟（认为很不雅观，但是音无觉得很酷）
Hand sonic version4（音速手刃4代）：出现于第六话，形似莲花，因体积大而可以撑破门，所述因可爱而造。
Hand sonic version5（音速手刃5代）：出现于第十话，形状类似巨钳，是按照音无所说“冷酷的要更加邪恶”而改制，音无觉得“比起，更像恶魔多点”；第十话中却被当成弹弓而使用 。
Distortion（扭曲）
首次出现于第一话 ，使指向自己靠惯性运动的运动物体发生偏转改变其运动路径。 （第二话中把打入身体的子弹也给弹了出来，还有排除自身受到的一定的伤害作用。）
Delay（延迟）
首次出现于第二话，从名称看应该是使对方对速度反应延迟，但动画表现上类似于闪避，在受攻击时突然加速，移动时带有残影。
Harmonics（分身）
出现于第三话资料中，制造与自己记忆、能力完全相同的分身。正式出现于第七话。第八话中被奏无意识之间分出的分身大量使用，量产复制体。 分身同时也具有自己的意识，不受主体控制。
Absorb（回收）
出现于第八话，为 Harmomics的反向技能，将放出的分身回收，不过每一个分身都有自我意识，回收时分身和本体的意识会融合。
Howling（音咆哮）
出现于第八话，是分身自己制作的技能，将2体音速手刃交叉后以音叉形式发出的音波冲击，大范围杀伤技能，作用具复制体的话看是击晕，但对使用耳塞的人无效（或将耳朵蒙上也可）。
Overdrive（能力提升）
出现于第七话钓鱼时，属于被动技能，提高自己的力量，具有惊人的爆发力。（第七话甩鱼竿把被钩住的竹山甩上了天，并且飞的影子都不见了）
Timewait（计时）
出现于第八话，由理为使分身消失而参考 Angelplayer 在电脑上做出的倒计时程序，只要使用 Harmomics 则经过 Timewait 设定的时间后，Absorb 自动发动，按由理的话看，设定时间必须不低于10秒。
Wing（翅膀）
听取音无的建议而增加的，第十话中提到，在11话中出现（化身天使，只是装饰，不存在BUG，也可协助从高空降落）。
天使的心跳中文版毕业典礼结束
毕业典礼结束后，文人、由理、日向先后离开，随后音无向奏提出了一起留在这里，并向奏表白，此时的奏没有说任何话，
因为一旦说出来，奏就会消失，在音无的追问下，奏说出了自己就是靠音无捐献的心脏活下来的人，据她自己认为，音无能取回自己的记忆，
是因为他在她的胸口上做了梦，是因为一直在倾听自己心脏跳动的声音。对于奏来说，唯一的遗憾就是还未向给予自己青春的音无道谢，正是因为这个心结，才误入了死后世界。
“你一直相信着的事情，也让我相信吧，活着是一件美好的事情”，奏这样请求音无将刚刚说的话再说一遍，最终音无再次向奏表白，
奏得以感谢音无给予的爱和生命而消失（重生）。在最后一集ED的最后一个画面，音无和奏重生后在现实生活中相遇，奏所哼的歌为学院内歌手创作的曲子。
